RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ipo9Q91YE6 1041 aa8.87□□□□□ -0.99
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc27Q3V036 639 aa8.86□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erbb3Q61526 1339 aa8.86□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa8.86□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrc2Q64449 1479 aa8.85□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpm2Q91YD4 1506 aa8.84□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa8.84□□□□□ -0.99
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kank1E9Q238 1360 aa8.84□□□□□ -0.99
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prm3Q62100 101 aa8.83□□□□□ -1
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shroom2A2ALU4 1481 aa8.83□□□□□ -1
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ak9G3UYQ4 1894 aa8.83□□□□□ -1
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa8.83□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa8.82□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 NeflP08551 543 aa8.79□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mink1Q9JM52 1308 aa8.79□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Setd1aE9PYH6 1716 aa8.78□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa8.77□□□□□ -1.01
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa8.76□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iqcf3Q9D498 203 aa8.76□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caskin1Q6P9K8 1431 aa8.75□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rock1P70335 1354 aa8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprgQ05909 1442 aa8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plch2A2AP18 1501 aa8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa8.74□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssh2Q5SW75 1423 aa8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pank3Q8R2W9 370 aa8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TnikP83510 1323 aa8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttll13A4Q9F6 804 aa8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrxO55103 1391 aa8.73□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Inpp5dQ9ES52 1191 aa8.72□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B4galnt3Q6L8S8 986 aa8.72□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp7aQ64430 1491 aa8.71□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox12Q04890 314 aa8.71□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd109Q8R422 1442 aa8.71□□□□□ -1.01
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa8.71□□□□□ -1.01
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esx1O88933 382 aa8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyclP10166 368 aa8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a5Q810P8 197 aa8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CrbnQ8C7D2 445 aa8.7□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex14Q7M6U3 1450 aa8.69□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif16bB1AVY7 1312 aa8.69□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan10Q3URR7 782 aa8.69□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clstn2Q9ER65 966 aa8.69□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DaxxO35613 739 aa8.68□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CanxP35564 591 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa8.68□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dbr1Q923B1 550 aa8.68□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa8.67□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx1-2P42580 305 aa8.67□□□□□ -1.02
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap5P97393 1501 aa8.67□□□□□ -1.02
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