RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mast1Q9R1L5 1570 aa16.59■□□□□ 0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa16.58■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa16.57■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myom3A2ABU4 1439 aa16.57■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neurl4Q5NCX5 1563 aa16.56■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fhod3Q76LL6 1578 aa16.56■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hecw1Q8K4P8 1604 aa16.56■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nos1Q9Z0J4 1429 aa16.56■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprgQ05909 1442 aa16.55■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naip5Q9R016 1403 aa16.54■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb4Q5F293 982 aa16.54■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 AglF8VPN4 1532 aa16.54■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Afap1Q80YS6 731 aa16.53■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3c2gO70167 1506 aa16.53■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp7aQ64430 1491 aa16.52■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc21bQ0HA38 1315 aa16.52■□□□□ 0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa16.52■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpm2Q91YD4 1506 aa16.52■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm2aP59997 1161 aa16.51■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc24a1Q91WD8 1130 aa16.51■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yeats2Q3TUF7 1407 aa16.51■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Synj2Q9D2G5 1434 aa16.51■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp10aO54827 1508 aa16.5■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gli2Q0VGT2 1544 aa16.49■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rundc1Q0VDN7 615 aa16.48■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Card11Q8CIS0 1159 aa16.48■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naip6Q9JIB6 1403 aa16.48■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc37F8VPK0 1563 aa16.47■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Washc2Q6PGL7 1334 aa16.46■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sall3Q62255 1320 aa16.46■□□□□ 0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsph4aQ8BYM7 716 aa16.46■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fndc1E9Q043 1732 aa16.45■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp1b4Q99ME6 356 aa16.45■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa16.44■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 ErbinQ80TH2 1402 aa16.44■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asxl1P59598 1514 aa16.43■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm5cP41230 1554 aa16.43■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dip2cE9PWR4 1557 aa16.42■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dapk1Q80YE7 1442 aa16.41■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20521D3Z5F7 333 aa16.4■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rock1P70335 1354 aa16.4■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc5gQ8C632 165 aa16.39■□□□□ 0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 NpatQ8BMA5 1420 aa16.39■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 P3h3Q8CG70 732 aa16.38■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 ShprhQ7TPQ3 1674 aa16.37■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyclP10166 368 aa16.37■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 RereQ80TZ9 1558 aa16.36■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plch2A2AP18 1501 aa16.35■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap65Q3V0B4 1847 aa16.34■□□□□ 0.21
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13695A2AK44 830 aa16.33■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tarbp1E9Q368 1579 aa16.33■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.33■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa16.32■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Robo2Q7TPD3 1470 aa16.32■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 AdgbG3UZ78 1657 aa16.32■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hecw2Q6I6G8 1578 aa16.32■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dot1lQ6XZL8 1540 aa16.31■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3aB2RXC6 1390 aa16.3■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camsap2Q8C1B1 1461 aa16.29■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abca17E9PX95 1733 aa16.29■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa16.28■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abca6Q8K441 1624 aa16.28■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif21bQ9QXL1 1668 aa16.28■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 AnkarA2RT91 1465 aa16.27■□□□□ 0.2
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.27■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mug2P28666 1451 aa16.27■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uggt2E9Q4X2 1504 aa16.26■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa16.26■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 AatkQ80YE4 1365 aa16.25■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa0556Q8C753 1610 aa16.25■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Txndc2Q6P902 515 aa16.25■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Talpid3E9PV87 1520 aa16.24■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcc6Q9R1S7 1498 aa16.24■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hfm1D3Z4R1 1434 aa16.24■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rock2P70336 1388 aa16.23■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa16.23■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo5cE9Q1F5 1742 aa16.22■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stk26Q99JT2 416 aa16.22■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp40Q8BWR4 1235 aa16.22■□□□□ 0.19
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prex1Q69ZK0 1650 aa16.21■□□□□ 0.19
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