RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029938.9

Gtf2b-201, Transcript of Transcription initiation factor IIB, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf2b, Length 1,455 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 PtprmP28828 1452 aa22.78■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Talpid3E9PV87 1520 aa22.78■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa22.77■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.77■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Brwd3A2AHJ4 1799 aa22.77■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Myom2Q14BI5 1463 aa22.77■■□□□ 1.24
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Uggt2E9Q4X2 1504 aa22.77■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.75■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Naip5Q9R016 1403 aa22.75■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ube2uB1AUC4 352 aa22.74■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Abca17E9PX95 1733 aa22.74■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Clstn2Q9ER65 966 aa22.73■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.73■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Abca6Q8K441 1624 aa22.71■■□□□ 1.23
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Gm13697A2AK42 830 aa22.68■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Zfp644E9QA22 1323 aa22.67■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.65■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.64■■□□□ 1.22
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 AlkP97793 1621 aa22.62■■□□□ 1.21
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa22.61■■□□□ 1.21
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Knl1Q66JQ7 1612 aa22.6■■□□□ 1.21
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 RictorQ6QI06 1708 aa22.57■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Dip2bQ3UH60 1574 aa22.57■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.57■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Hfm1D3Z4R1 1434 aa22.56■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.55■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.55■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ttc21bQ0HA38 1315 aa22.53■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.53■■□□□ 1.2
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Bcl9Q9D219 1425 aa22.51■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa22.51■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Nsd2Q8BVE8 1365 aa22.5■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Myom3A2ABU4 1439 aa22.5■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Adamts7Q68SA9 1657 aa22.49■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Trak1Q6PD31 939 aa22.48■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.48■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Asxl1P59598 1514 aa22.47■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.47■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Cd109Q8R422 1442 aa22.47■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.43■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 AnkarA2RT91 1465 aa22.43■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Topaz1E5FYH1 1653 aa22.43■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 PtprgQ05909 1442 aa22.43■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ccer2J3QPU5 274 aa22.41■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Erich6D3Z6S9 713 aa22.41■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa22.39■■□□□ 1.18
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Mier1Q5UAK0 511 aa22.39■■□□□ 1.17
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Akap12Q9WTQ5 1684 aa22.36■■□□□ 1.17
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Dip2aQ8BWT5 1523 aa22.35■■□□□ 1.17
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Skint5A7XUY5 1461 aa22.33■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Atp7aQ64430 1491 aa22.32■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Stk24Q99KH8 431 aa22.31■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Pip4k2bQ80XI4 416 aa22.3■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Pkd2O35245 966 aa22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ino80Q6ZPV2 1559 aa22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Scn4aQ9ER60 1841 aa22.26■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Tecpr2Q3UH45 1423 aa22.26■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Efcab6Q6P1E8 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Txndc2Q6P902 515 aa22.24■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 ErbinQ80TH2 1402 aa22.23■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Iqgap3F8VQ29 1632 aa22.23■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ncoa1P70365 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Naip7Q9JIB3 1402 aa22.2■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.19■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Sall3Q62255 1320 aa22.18■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 P3h3Q8CG70 732 aa22.18■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Uggt1Q6P5E4 1551 aa22.17■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Gm13695A2AK44 830 aa22.15■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa22.15■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Rims2Q9EQZ7 1530 aa22.15■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Psme1P97371 249 aa22.15■■□□□ 1.14
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.14■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Kif13aQ9EQW7 1749 aa22.13■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa22.13■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 AatkQ80YE4 1365 aa22.12■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Eid3Q3V124 375 aa22.12■■□□□ 1.13
Gtf2b-201ENSMUST00000029938 Pik3c2gO70167 1506 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms