RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29,38■■■□□ 2,29
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa29,36■■■□□ 2,29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Robo2Q7TPD3 1470 aa29,36■■■□□ 2,29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP29,35■■■□□ 2,29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29,34■■■□□ 2,29
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Polr3aB2RXC6 1390 aa29,31■■■□□ 2,28
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP29,28■■■□□ 2,28
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP29,27■■■□□ 2,28
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep170Q6A065 1588 aa29,26■■■□□ 2,27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Card11Q8CIS0 1159 aa29,24■■■□□ 2,27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP29,23■■■□□ 2,27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plekhg5Q66T02 1073 aa29,23■■■□□ 2,27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa29,23■■■□□ 2,27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29,11■■■□□ 2,25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP29,11■■■□□ 2,25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plch2A2AP18 1501 aa29,05■■■□□ 2,24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 OvosQ3UU35 1456 aa29,05■■■□□ 2,24
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5cP41230 1554 aa29,03■■■□□ 2,24
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp10aO54827 1508 aa28,99■■■□□ 2,23
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tulp4Q9JIL5 1547 aa28,94■■■□□ 2,22
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrs2Q5NCE8 434 aa28,9■■■□□ 2,22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Depdc5P61460 1591 aa28,89■■■□□ 2,22
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28,74■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP28,74■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dip2cE9PWR4 1557 aa28,74■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc24a1Q91WD8 1130 aa28,73■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col17a1Q07563 1470 aa28,73■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28,71■■■□□ 2,19
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trpm1Q2TV84 1622 aa28,71■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28,71■■■□□ 2,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28,7■■■□□ 2,19
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sbno1Q689Z5 1390 aa28,68■■■□□ 2,18
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