RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca17E9PX95 1733 aa29.37■■■□□ 2.29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa29.36■■■□□ 2.29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Robo2Q7TPD3 1470 aa29.36■■■□□ 2.29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29.34■■■□□ 2.29
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp7aQ64430 1491 aa29.33■■■□□ 2.29
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Polr3aB2RXC6 1390 aa29.31■■■□□ 2.28
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep170Q6A065 1588 aa29.26■■■□□ 2.27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa29.26■■■□□ 2.27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 ShprhQ7TPQ3 1674 aa29.25■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pde4cQ3UEI1 686 aa29.24■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Card11Q8CIS0 1159 aa29.24■■■□□ 2.27
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plekhg5Q66T02 1073 aa29.23■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa29.23■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rock2P70336 1388 aa29.21■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tarbp1E9Q368 1579 aa29.2■■■□□ 2.27
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nos1Q9Z0J4 1429 aa29.19■■■□□ 2.26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Washc2Q6PGL7 1334 aa29.18■■■□□ 2.26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tnnt3Q9QZ47 272 aa29.18■■■□□ 2.26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lemd3Q9WU40 921 aa29.17■■■□□ 2.26
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arid3cA6PWV5 409 aa29.13■■■□□ 2.25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myo5cE9Q1F5 1742 aa29.12■■■□□ 2.25
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plch2A2AP18 1501 aa29.05■■■□□ 2.24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 OvosQ3UU35 1456 aa29.05■■■□□ 2.24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Setd1aE9PYH6 1716 aa29.04■■■□□ 2.24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5cP41230 1554 aa29.03■■■□□ 2.24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adamts13Q769J6 1426 aa29.02■■■□□ 2.24
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf710Q3U288 666 aa29.01■■■□□ 2.23
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif3bQ61771 747 aa29■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp10aO54827 1508 aa28.99■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fndc1E9Q043 1732 aa28.99■■■□□ 2.23
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28.96■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AnkarA2RT91 1465 aa28.96■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Uggt2E9Q4X2 1504 aa28.96■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa28.96■■■□□ 2.23
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AglF8VPN4 1532 aa28.95■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.94■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm156Q58A37 223 aa28.94■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tulp4Q9JIL5 1547 aa28.94■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa28.93■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc6Q9R1S7 1498 aa28.92■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca6Q8K441 1624 aa28.91■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrs2Q5NCE8 434 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Depdc5P61460 1591 aa28.89■■■□□ 2.22
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ttc21bQ0HA38 1315 aa28.89■■■□□ 2.21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.88■■■□□ 2.21
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Exoc6Q8R313 802 aa28.85■■■□□ 2.21
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prex1Q69ZK0 1650 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Erich6D3Z6S9 713 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NrdcQ8BHG1 1161 aa28.83■■■□□ 2.21
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 ErbinQ80TH2 1402 aa28.82■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.81■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa28.81■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aplp2Q06335 707 aa28.8■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca8aQ8K442 1620 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa28.78■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RereQ80TZ9 1558 aa28.75■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ptch1Q61115 1434 aa28.75■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.74■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.74■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc24a1Q91WD8 1130 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col17a1Q07563 1470 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pola1P33609 1465 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.7■■■□□ 2.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sall3Q62255 1320 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AdgbG3UZ78 1657 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sbno1Q689Z5 1390 aa28.68■■■□□ 2.18
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