RNA–Protein interactions for RNA: YMR158W

MRPS8, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS8, Length 468 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS8	YMR158W	IGO1	P53897	168 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS8	YMR158W	SUR7	P54003	302 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS8	YMR158W	SED5	Q01590	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS8	YMR158W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPS8	YMR158W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MRPS8	YMR158W	FRM2	P37261	193 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	YSW1	P38280	609 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	RCK2	P38623	610 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	ATG7	P38862	630 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	GGC1	P38988	300 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	CPR7	P47103	393 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	MRX8	Q05473	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	MMT2	Q08970	484 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	PUP2	P32379	260 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	PEX5	P35056	612 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	LST7	P53237	242 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	SMP3	Q04174	516 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	DAP2	P18962	818 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	IME2	P32581	645 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	TRR2	P38816	342 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	JEM1	P40358	645 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	YOR012W	Q12351	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	GRR1	P24814	1151 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	TIP20	P33891	701 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	YIR035C	P40579	254 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	MPS2	P53159	387 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	ZRG17	P53735	605 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	YNR068C	P53754	272 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	SFG1	Q12507	346 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	CKI1	P20485	582 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	UFE1	P41834	346 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	INP2	Q03824	705 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	ALE1	Q08548	619 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	AST1	P35183	429 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	RBG1	P39729	369 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	CSM3	Q04659	317 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRPS8	YMR158W	COX10	P21592	462 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	MRPS5	P33759	307 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	IST2	P38250	946 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	BDH1	P39714	382 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YNL320W	P42840	284 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	MAS1	P10507	462 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	URA10	P30402	227 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	MKK1	P32490	508 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RXT2	P38255	430 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	TAE1	P38340	232 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	NAT4	Q04751	285 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	CKA2	P19454	339 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YCH1	P42937	148 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YFR018C	P43599	363 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	NAS6	P50086	228 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	NRM1	P53718	249 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	TAF10	Q12030	206 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	APC2	Q12440	853 aa		3	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	UTR1	P21373	530 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	MXR2	P25566	168 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YKL071W	P36086	256 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	SPO73	P40031	143 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	COS4	P43542	379 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RPN14	P53196	417 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	PRM1	P53835	661 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	APC5	Q08683	685 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	GLE1	Q12315	538 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RPN6	Q12377	434 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	FRE6	Q12473	712 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RDS1	P25611	832 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	SRB2	P34162	210 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	PCH2	P38126	564 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	EFM1	P38732	585 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YIL059C	P40520	121 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	YHC3	P47040	408 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	DIA1	P54005	336 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	APC4	Q04601	652 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	SKS1	Q12505	502 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	RAD1	P06777	1100 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	HMX1	P32339	317 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
MRPS8	YMR158W	DAD2	P36162	133 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS8	YMR158W	EOS1	P53938	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.7 ms