RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	TMA10	Q06177	86 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ASR1	Q06834	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	BDS1	Q08347	646 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	FDH1	Q08911	376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YPL247C	Q12523	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CBP1	P07252	654 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SDH2	P21801	266 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	UTR2	P32623	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MRPL6	P32904	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PAM16	P42949	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YAR1	P46683	200 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YAP6	Q03935	383 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ERP3	Q12403	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	AHC1	Q12433	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PRE4	P30657	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
RGT1	YKL038W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	NAS2	P40555	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	VNX1	P42839	908 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ROG1	P53118	685 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YDR366C	P87287	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	UBX3	Q12229	455 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	VOA1	P53262	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YNR065C	P53751	1116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
RGT1	YKL038W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YLR049C	Q12110	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CDC34	P14682	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SGF29	P25554	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	BUB3	P26449	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	APL3	P38065	1025 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	VPS45	P38932	577 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ERV46	P39727	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GET2	P40056	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ATM1	P40416	690 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MAF1	P41910	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PHO86	P46956	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YSA1	Q01976	231 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SKY1	Q03656	742 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PUN1	Q06991	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	DDC1	Q08949	612 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PRB1	P09232	635 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YOL163W	P0CF20	169 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
RGT1	YKL038W	YPT7	P32939	208 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	AIM25	P47140	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SWC4	P53201	476 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	HED1	Q03937	162 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RKM2	Q03942	479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	IZH3	Q07959	543 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YOL019W	Q08157	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SNF8	Q12483	233 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RIP1	P08067	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ALY1	P36117	915 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YHR035W	P38769	630 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	SWM2	P40342	146 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MND2	P40577	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	BUD32	P53323	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	ALG12	P53730	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	GAS3	Q03655	524 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	EMC1	P25574	760 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RGT1	YKL038W	YCR061W	P25639	631 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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