RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 STILQ15468 1287 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ZNF575Q86XF7 245 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ASB15Q8WXK1 588 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 WNK4Q96J92 1243 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 CD248Q9HCU0 757 aa5.74□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 FOXP2O15409 715 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 SDSP20132 328 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ZNF460Q14592 562 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 BTBD2Q9BX70 525 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.73□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 PREX2Q70Z35 1606 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 TRAF5O00463 557 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 CUTAO60888 179 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ECE1P42892 770 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 IRF9Q00978 393 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 GBP4Q96PP9 640 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 PTPN18Q99952 460 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 BOCQ9BWV1 1114 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 ASB1Q9Y576 335 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 FANCAO15360 1455 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 NEO1Q92859 1461 aa5.72□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 GLI2P10070 1586 aa5.71□□□□□ -1.49
CASC19-241ENST00000641582 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 GPR42O15529 346 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 OPA1O60313 960 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 HIP1RO75146 1068 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 TGFB2P61812 414 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SLFN13Q68D06 897 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CHST14Q8NCH0 376 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.71□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 KIF15Q9NS87 1388 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 DVL2O14641 736 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 KANK2Q63ZY3 851 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 HOMER1Q86YM7 354 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 HIPK4Q8NE63 616 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 FBXO10Q9UK96 956 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ABCC1P33527 1531 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 JMJD7P0C870 316 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ETV4P43268 484 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CD83Q01151 205 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 TCEA2Q15560 299 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 AFAP1Q8N556 730 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 DNERQ8NFT8 737 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 OR10A5Q9H207 317 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 JADE2Q9NQC1 790 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ADGRL1O94910 1474 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 CBX4O00257 560 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 KRT37O76014 449 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 ADCY8P40145 1251 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 INHBEP58166 350 aa5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CASC19-241ENST00000641582 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms