RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640765.1

TRPS1-212, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 9,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-212ENST00000640765 MAPKAPK2P49137 400 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 PDZK1Q5T2W1 519 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 JPH4Q96JJ6 628 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 TMOD1P28289 359 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 AKR1D1P51857 326 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 MFAP3P55082 362 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 SLC7A5Q01650 507 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 CALML6Q8TD86 181 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 YY1P25490 414 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 SERPINB8P50452 374 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 ARL4CP56559 192 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 FAM47EQ6ZV65 393 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 ANO3Q9BYT9 981 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 LIG4P49917 911 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 APOA5Q6Q788 366 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 APPL2Q8NEU8 664 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 NDUFAF2Q8N183 169 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 CFAP69A5D8W1 941 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ABL1P00519 1130 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 MSR1P21757 451 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 DYMQ7RTS9 669 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 IMPAD1Q9NX62 359 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 CAAP1Q9H8G2 361 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ALBP02768 609 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 EFR3AQ14156 821 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 PRUNE1Q86TP1 453 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 FSD1LQ9BXM9 530 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ABCB6Q9NP58 842 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ULK4Q96C45 1275 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 LONP2Q86WA8 852 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 ENKURQ8TC29 256 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-212ENST00000640765 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-212ENST00000640765 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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