RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	NOX5	Q96PH1	765 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	WDR24	Q96S15	920 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	CARD6	Q9BX69	1037 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	GCNT4	Q9P109	453 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PNKP-231	ENST00000640501	SCN4A	P35499	1836 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SFI1	A8K8P3	1242 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CLIC2	O15247	247 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PJA2	O43164	708 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	TGFB1I1	O43294	461 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	UCHL3	P15374	230 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	STAT1	P42224	750 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CHMP4BP1	P59074	171 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	KCNMA1	Q12791	1236 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	BFSP1	Q12934	665 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PRKG1	Q13976	671 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SLC18A3	Q16572	532 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	BAP1	Q92560	729 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SLC35C1	Q96A29	364 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	FAM167A	Q96KS9	214 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CEP170P1	Q96L14	293 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	MROH8	Q9H579	483 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	RIPK3	Q9Y572	518 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	OTOF	Q9HC10	1997 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ARID2	Q68CP9	1835 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PTPRF	P10586	1907 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	RASSF10	A6NK89	507 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC169	A6NNP5	214 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	TADA3	O75528	432 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PPP1R37	O75864	691 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	KCNA2	P16389	499 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PRLR	P16471	622 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PON1	P27169	355 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	EPHX2	P34913	555 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	HOXD13	P35453	343 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	RFC5	P40937	340 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGAP25	P42331	645 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	FMO5	P49326	533 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CYP2J2	P51589	502 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	PEX3	P56589	373 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ACTR2	P61160	394 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	HERVK_113	P62684	666 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CCNA1	P78396	465 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	MYL7	Q01449	175 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	STRN3	Q13033	797 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	DGKZ	Q13574	1117 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	KCTD2	Q14681	263 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ELF2	Q15723	593 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CAGE1	Q8TC20	777 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	STRA6	Q9BX79	667 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	STK33	Q9BYT3	514 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	AZI2	Q9H6S1	392 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF302	Q9NR11	478 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	DMAC2	Q9NW81	257 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PNKP-231	ENST00000640501	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96

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