RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGAP6	O43182	974 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	LCA5L	O95447	670 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	HSPA6	P17066	643 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	GBP1	P32455	592 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	LSP1	P33241	339 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RFC5	P40937	340 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TCIRG1	Q13488	830 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	KRT32	Q14532	448 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	C6orf183	Q5T699	404 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF220	Q5VTB9	566 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ATL3	Q6DD88	541 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	AGAP11	Q8TF27	550 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF34	Q969K3	372 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CD93	Q9NPY3	652 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NAIP	Q13075	1403 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	NUTM2F	A1L443	756 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	UBXN8	O00124	270 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	AKAP10	O43572	662 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CBFA2T3	O75081	653 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ASPH	Q12797	758 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CUL1	Q13616	776 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RUBCN	Q92622	972 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	EURL	Q9NYK6	297 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NECAP1-222	ENST00000640072	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072		F5H423	210 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SGK1	O00141	431 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GUCY1B2	O75343	617 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	OLFM2	O95897	454 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	RSPH10B	P0C881	870 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SEC24C	P53992	1094 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FANCC	Q00597	558 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MCL1	Q07820	350 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SGCG	Q13326	291 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	XRCC4	Q13426	336 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TRPC3	Q13507	836 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PTGIS	Q16647	500 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	VPS36	Q86VN1	386 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	P3H4	Q92791	437 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CMTM3	Q96MX0	182 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SDF4	Q9BRK5	362 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MIS12	Q9H081	205 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	HACD3	Q9P035	362 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TRPA1	O75762	1119 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PPP1R37	O75864	691 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IL32	P24001	234 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NUBP1	P53384	320 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDN10	P78369	228 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ADAM9	Q13443	819 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CNST	Q6PJW8	725 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GALNT7	Q86SF2	657 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	OCEL1	Q9H607	264 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	DPP7	Q9UHL4	492 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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