RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC80Q76M96 950 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SPIRE2Q8WWL2 714 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 GATA6Q92908 595 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CHMP2BQ9UQN3 213 aa19■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ATP9AO75110 1047 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ENTPD5O75356 428 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ASIC1P78348 528 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 FUT2Q10981 343 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 INTUQ9ULD6 942 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 UBA7P41226 1012 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TRAPPC10P48553 1259 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa18.99■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTS3O15072 1205 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RASA1P20936 1047 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PLTPP55058 493 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 KCNMA1Q12791 1236 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SLF2Q8IX21 1173 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 FAM81BQ96LP2 452 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 NAT1P18440 290 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.98■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SUPT3HO75486 399 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 KLRC3Q07444 240 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 AUHQ13825 339 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RNF43Q68DV7 783 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CGB2Q6NT52 195 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 VSIG1Q86XK7 387 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 GDAP1Q8TB36 358 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CEP72Q9P209 647 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 HAO1Q9UJM8 370 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SKIP12755 728 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 DNAAF5Q86Y56 855 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM9Q9C026 710 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RPTORQ8N122 1335 aa18.97■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM120BA0PK00 339 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RASGRF2O14827 1237 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 VHLP40337 213 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 STKLD1Q8NE28 680 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 NR2E1Q9Y466 385 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 RGPD5Q99666 1765 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TNKSO95271 1327 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ASLP04424 464 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 EPHB2P29323 1055 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CENPPQ6IPU0 288 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 PEX26Q7Z412 305 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF653Q96CK0 615 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 NOL4O94818 638 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 ETS2P15036 469 aa18.96■□□□□ 0.63
GLIS1-202ENST00000628545 CREB1P16220 341 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms