RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 MBOAT7Q96N66 472 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 DISC1Q9NRI5 854 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 GAS7O60861 476 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 RPS6KA5O75582 802 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 JAK3P52333 1124 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 DUSP6Q16828 381 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ODR4Q5SWX8 454 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ASIC4Q96FT7 647 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 SAMM50Q9Y512 469 aa24.87■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 MAGEB2O15479 319 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 MGEA5O60502 916 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 GPR32O75388 356 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PSMD10O75832 226 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 OATP04181 439 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PRKCEQ02156 737 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PTPN21Q16825 1174 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 RDM1Q8NG50 284 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 AIFM3Q96NN9 605 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 GINS2Q9Y248 185 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 STK36Q9NRP7 1315 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 FGF18O76093 207 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 TDP2O95551 362 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 STK3Q13188 491 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 UGCGQ16739 394 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 KIZQ2M2Z5 673 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 FAM228AQ86W67 206 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 RGS18Q9NS28 235 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 DENND3A2RUS2 1198 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PER2O15055 1255 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 GPR182O15218 404 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 GFRA3O60609 400 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 VTNP04004 478 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 CLCN3P51790 818 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ANAPC15P60006 121 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 SCRN1Q12765 414 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 METTL13Q8N6R0 699 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 OSMRQ99650 979 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 USP34Q70CQ2 3546 aa24.84■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 C9IYK1 514 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 FSCN2O14926 492 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 CDKL5O76039 1030 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 MAP7D2Q96T17 732 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 ADAM2Q99965 735 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 LZTS1Q9Y250 596 aa24.83■■□□□ 1.57
SRRT-218ENST00000620394 CHMP2AO43633 222 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PFKFB2O60825 505 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 LAG3P18627 525 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PLXNA3P51805 1871 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NUBP1P53384 320 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 DSC3Q14574 896 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 GJA10Q969M2 543 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 CACNA1HO95180 2353 aa24.82■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TMOD1P28289 359 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 AVPR2P30518 371 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ERVFC1P60507 584 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 KCNC3Q14003 757 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD54Q6NXT1 300 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB33Q86T24 672 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.81■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.8■■□□□ 1.56
SRRT-218ENST00000620394 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.8■■□□□ 1.56
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