RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 SMC2O95347 1197 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 C7orf31Q8N865 590 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 MAGEB2O15479 319 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 COL6A1P12109 1028 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 GLRA2P23416 452 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 STK4Q13043 487 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 WNT8BQ93098 351 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 GDAQ9Y2T3 454 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 BRCA2P51587 3418 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 FAM13AO94988 1023 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 CDK7P50613 346 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 RTP1P59025 263 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 IER5Q5VY09 327 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 PARVGQ9HBI0 331 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.16■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 PLS3P13797 630 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 GAP43P17677 238 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 CASP5P51878 434 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 KSR1Q8IVT5 923 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 MYCT1Q8N699 235 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 KIFAP3Q92845 792 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 DRC1Q96MC2 740 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 STRA6Q9BX79 667 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 EXOC1Q9NV70 894 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ARVCFO00192 962 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 CYP2C9P11712 490 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 NPTX2P47972 431 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP12P59046 1061 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF445P59923 1031 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 TYRO3Q06418 890 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 CAPSQ13938 189 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 METTL13Q8N6R0 699 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SIP14410 1827 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 HOXD13P35453 343 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PEX3P56589 373 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ODR4Q5SWX8 454 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SERINC5Q86VE9 423 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 RMND1Q9NWS8 449 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.13■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R37O75864 691 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 VTNP04004 478 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 MYBP10242 640 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 GNAT1P11488 350 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 NCKAP1LP55160 1127 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PSMD2Q13200 908 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 RETREG2Q8NC44 543 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 TCP11Q8WWU5 503 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CSAG3-202ENST00000617158 MED15Q96RN5 788 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms