RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BAG3O95817 575 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FGGP02679 453 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SHBGP04278 402 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLTAP09496 248 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L8P0C7I0 530 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PLA2G4BP0C869 781 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNHG28P0DPA3 235 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP11B2P19099 503 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VCAM1P19320 739 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC9A1P19634 815 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RASA1P20936 1047 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP3A7P24462 503 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HOXD13P35453 343 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STAT1P42224 750 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MSH2P43246 934 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC18A1P54219 525 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC12A3P55017 1021 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RWDD2BP57060 319 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 INHBEP58166 350 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNJ2P63252 427 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DR1Q01658 176 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ECM1Q16610 540 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 JAMLQ86YT9 394 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RELL1Q8IUW5 271 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HAS1Q92839 578 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STK33Q9BYT3 514 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIM7Q9C029 511 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ECT2Q9H8V3 914 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP40Q9NVE5 1235 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WHRNQ9P202 907 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP20Q9Y2K6 914 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NR2E1Q9Y466 385 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PFASO15067 1338 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 COL4A1P02462 1669 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCA3Q99758 1704 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANKRD62A6NC57 917 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L3A6NCW0 530 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L4A6NCW7 530 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATP2C2O75185 946 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNC5CO95185 931 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TDP2O95551 362 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LDHCP07864 332 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRT16P08779 473 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINGO3P0C6S8 592 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSPY3P0CV98 308 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSPY8P0CW00 308 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACTN1P12814 892 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RFX1P22670 979 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CALB2P22676 271 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NR2F2P24468 414 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATP5DP30049 168 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SOX5P35711 763 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABL2P42684 1182 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PEX5P50542 639 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms