RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611614.4

COPS7B-223, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7B, Length 2,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7B-223	ENST00000611614	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	AKR1B10	O60218	316 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	STAM2	O75886	525 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	HUNK	P57058	714 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	WDR78	Q5VTH9	848 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CDHR1	Q96JP9	859 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	IWS1	Q96ST2	819 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MMS19	Q96T76	1030 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EFCC1	Q9HA90	598 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CEP72	Q9P209	647 aa		15.2	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	PDHX	O00330	501 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SRGAP2	O75044	1071 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TACC1	O75410	805 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CYP4A11	Q02928	519 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	GIT2	Q14161	759 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TRIM58	Q8NG06	486 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SAMM50	Q9Y512	469 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	PSMC6	P62333	389 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CCNA1	P78396	465 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	KCTD2	Q14681	263 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SPRYD7	Q5W111	196 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	GPRASP2	Q96D09	838 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		15.19	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	PEX10	O60683	326 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ADAM9	Q13443	819 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EPHA7	Q15375	998 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	STXBP2	Q15833	593 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	IQCE	Q6IPM2	695 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TPH2	Q8IWU9	490 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	RUBCN	Q92622	972 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MROH8	Q9H579	483 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EML1	O00423	815 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CETN3	O15182	167 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	PJA2	O43164	708 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	NOL4	O94818	638 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CYP2C8	P10632	490 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MAGEA1	P43355	309 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CST9	Q5W186	159 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	NEK9	Q8TD19	979 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		15.18	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MUT	P22033	750 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ERVK-9	P63128	1117 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	REEP2	Q9BRK0	252 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	RGL1	Q9NZL6	768 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	BTBD19	C9JJ37	291 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CNMD	O75829	334 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	DYDC2	Q96IM9	177 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		15.17	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SERPING1	P05155	500 aa		15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CNTN2	Q02246	1040 aa		15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
COPS7B-223	ENST00000611614	SFR1	Q86XK3	245 aa		15.16	■□□□□ 0.02

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