RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PRKCQQ04759 706 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MYL10Q9BUA6 226 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CPVLQ9H3G5 476 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CXCL14O95715 111 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CTSAP10619 480 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CLCN4P51793 760 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ADAM2Q99965 735 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LAMA1P25391 3075 aa13.46□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 KAT6AQ92794 2004 aa13.46□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS20P59510 1910 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FAM170BA6NMN3 283 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 OFD1O75665 1012 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FZD5Q13467 585 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GIT2Q14161 759 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 VPS52Q8N1B4 723 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TMEM40Q8WWA1 233 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 STAMQ92783 540 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KALRNO60229 2985 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.45□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FOXP2O15409 715 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FGRP09769 529 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 LAMP2P13473 410 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GPC5P78333 572 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MTAPQ13126 283 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NEDD9Q14511 834 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 HS1BP3Q53T59 392 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 PDZD3Q86UT5 571 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GPSM3Q9Y4H4 160 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.44□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 DENND3A2RUS2 1198 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SHISA7A6NL88 538 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 M0QZ92 97 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ORC4O43929 436 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CFBP00751 764 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 APPP05067 770 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CCND2P30279 289 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CA8P35219 290 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FOXC1Q12948 553 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 DSC3Q14574 896 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 STPG1Q5TH74 334 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KIF12Q96FN5 646 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 HOXA2O43364 376 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MARK3P27448 753 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NRLP54845 237 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms