RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.8□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 STX6O43752 255 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ITGB1P05556 798 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CYP3A4P08684 503 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SDHBP21912 280 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FOSBP53539 338 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NUCB2P80303 420 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR1Q13613 665 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 NEDD9Q14511 834 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CEP55Q53EZ4 464 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TBCKQ8TEA7 893 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D5Q92609 795 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 AIFM3Q96NN9 605 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SDF4Q9BRK5 362 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.79□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SOBPA7XYQ1 873 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 BTBD18B2RXH4 712 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 HAS3O00219 553 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ARIH2O95376 493 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MMP3P08254 477 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SYT1P21579 422 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TGM1P22735 817 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 GUCY1B3Q02153 619 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 LETM2Q2VYF4 491 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SERINC5Q86VE9 423 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 HINFPQ9BQA5 517 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RTKNQ9BST9 563 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 RAB34Q9BZG1 259 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 JADE2Q9NQC1 790 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 COL20A1Q9P218 1284 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CDH22Q9UJ99 828 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.78□□□□□ -1
ZNF548-208ENST00000597576 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 M0R2N6 131 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 LAD1O00515 517 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TBX3O15119 743 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 GH1P01241 217 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ASGR2P07307 311 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CYP3A7P24462 503 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CIITAP33076 1130 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 LAMC2Q13753 1193 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 INF2Q27J81 1249 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 Q4G0T1 1027 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ATL3Q6DD88 541 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FLCNQ8NFG4 579 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FAM20AQ96MK3 541 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM260Q9NX78 707 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 STK24Q9Y6E0 443 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MEIS1O00470 390 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NEMFO60524 1076 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 F2P00734 622 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RSPH10BP0C881 870 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 HOXC8P31273 242 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CHMP4BP1P59074 171 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms