RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 MYL1P05976 194 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SETSIPP0DME0 302 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CACNA2D1P54289 1103 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 EVX2Q03828 476 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 KCNH2Q12809 1159 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 BNIP1Q12981 228 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GJB7Q6PEY0 223 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF365Q70YC5 407 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CERKQ8TCT0 537 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CENPPQ6IPU0 288 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 KIFAP3Q92845 792 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GJA10Q969M2 543 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 STOML1Q9UBI4 398 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 NAGPAQ9UK23 515 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CYP27B1O15528 508 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CYP2D6P10635 497 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 RCN1Q15293 331 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TMED2Q15363 201 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CENPTQ96BT3 561 aa16.63■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TFAP4Q01664 338 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 NPY5RQ15761 445 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LRRC15Q8TF66 581 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 FAM210AQ96ND0 272 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SMCO2A6NFE2 343 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 A6NHS1 94 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TXNDC9O14530 226 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 KRT15P19012 456 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ATP6V1C1P21283 382 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 NR2F2P24468 414 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LRRC63Q05C16 580 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MESDQ14696 234 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CALCRLQ16602 461 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 PNMA1Q8ND90 353 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 RAB34Q9BZG1 259 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 VCX3BQ9H321 246 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 VCX3AQ9NNX9 186 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GALCP54803 685 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CTSWP56202 376 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 UNC13DQ70J99 1090 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TNFRSF25Q93038 417 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 BTG4Q9NY30 223 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SPOPO43791 374 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LCA5LO95447 670 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ADAMTS2O95450 1211 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TNFAIP3P21580 790 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GYG1P46976 350 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 KYNUQ16719 465 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 TBCKQ8TEA7 893 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 BCS1LQ9Y276 419 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ATP5DP30049 168 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.61■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MAPK13O15264 365 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 MEGF6O75095 1541 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 DDAH1O94760 285 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 EVA1CP58658 441 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 CROCCP2Q86T23 111 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 FAM13CQ8NE31 585 aa16.6■□□□□ 0.25
PDE4C-211ENST00000597360 PGM2Q96G03 612 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms