RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FIBCD1Q8N539 461 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFLR1Q9H665 355 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 STK24Q9Y6E0 443 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF286BP0CG31 522 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 AVPR2P30518 371 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R5CQ13362 524 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 HIC1Q14526 733 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 RDM1Q8NG50 284 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PPTC7Q8NI37 304 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01565O15544 149 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP9AO75110 1047 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GGPS1O95749 300 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.822e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-214ENST00000592483 TXKP42681 527 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 VCPP55072 806 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMC2Q13753 1193 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PDIA5Q14554 519 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 AK8Q96MA6 479 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SFNP31947 248 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NUBP1P53384 320 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SP2Q02086 613 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 VAV3Q9UKW4 847 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CUTAO60888 179 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00271P0C7V0 271 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFV1P49821 464 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 JAK3P52333 1124 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ASIC4Q96FT7 647 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A4O43511 780 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PPFIA4O75335 1185 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ME1P48163 572 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXNA3P51805 1871 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TCHHQ07283 1943 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR64B1ANS9 1081 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 H0Y858 1186 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 COASYQ13057 564 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ERMNQ8TAM6 284 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 APBB2Q92870 758 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR9Q9NR96 1032 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 DCHS1Q96JQ0 3298 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CAND2O75155 1236 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TECP42680 631 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC1BQ9P126 229 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 IL17AQ16552 155 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA10Q969M2 543 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA33Q96N06 139 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DMDP11532 3685 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ATG7O95352 703 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTR2P61160 394 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHA7Q15375 998 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ADALQ6DHV7 355 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 EFHBQ8N7U6 833 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PLVAPQ9BX97 442 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPC6Q9Y210 931 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-214ENST00000592483 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.36■■□□□ 1.81
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