RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ABLIM3O94929 683 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 FGAP02671 866 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 CAPNS1P04632 268 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCD1P51178 756 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE1AP54750 535 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 DOC2BQ14184 412 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF6Q15052 776 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC1Q99614 292 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 MENTQ9BUN1 341 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 CABP5Q9NP86 173 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-216ENST00000590105 C19orf81C9J6K1 198 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKAB2O43741 272 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 MBD4O95243 580 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ASNSP08243 561 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SELPP16109 830 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 FLT3P36888 993 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP2R2AP63151 447 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SP3Q02447 781 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NUCB1Q02818 461 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SPP2Q13103 211 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CRHR2Q13324 411 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NSMFQ6X4W1 530 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 LCORLQ8N3X6 602 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR18Q9BV38 432 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PNMA2Q9UL42 364 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PDHXO00330 501 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TLR2O60603 784 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO21O94952 628 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAT2P19087 354 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NEK4P51957 841 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GABREP78334 506 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 POU5F1BQ06416 359 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 MOGSQ13724 837 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N3U1 123 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NME8Q8N427 588 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBP2Q969R2 916 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ERO1AQ96HE7 468 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 IFT22Q9H7X7 185 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM75PA6NK02 468 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GABRDO14764 452 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CHGBP05060 677 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 APPP05067 770 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK8P49336 464 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 BACE1P56817 501 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 JAG1P78504 1218 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GABPAQ06546 454 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 IKBKEQ14164 716 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SBK1Q52WX2 424 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 C12orf60Q5U649 245 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms