RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	CHRNA1	P02708	482 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	HOXD13	P35453	343 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TLE2	Q04725	743 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNB1	Q14721	858 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	NME8	Q8N427	588 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	POLD4	Q9HCU8	107 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ASAP2	O43150	1006 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	HIP1R	O75146	1068 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CAND2	O75155	1236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	MBD3	O95983	291 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	EDN1	P05305	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	GNAT1	P11488	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	PLS3	P13797	630 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ITGB8	P26012	769 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	GPC3	P51654	580 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CLCN3	P51790	818 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	PNOC	Q13519	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	POSTN	Q15063	836 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	PTGIS	Q16647	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	AMHR2	Q16671	573 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CYP2C9	P11712	490 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	AFM	P43652	599 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	NPTX2	P47972	431 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	PTEN	P60484	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	GTF2B	Q00403	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	AMPD3	Q01432	767 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CAPS	Q13938	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	MORC3	Q14149	939 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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