RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585299.1

NFE2L1-223, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-223	ENST00000585299	RFC5	P40937	340 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	NLRP7	Q8WX94	980 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	PPM1E	Q8WY54	764 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	RGS18	Q9NS28	235 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	DENND3	A2RUS2	1198 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	POTEM	A6NI47	508 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR52Z1	P0C646	297 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	DSC3	Q14574	896 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	XKR9	Q5GH70	373 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		18.79	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299		C9IYK1	514 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAM189B	P81408	668 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	EPC2	Q52LR7	807 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF410	Q86VK4	478 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM192	Q8IY95	271 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299		A0A087WZ62	844 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	TEC	P42680	631 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	NBR1	Q14596	966 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	MCTP1	Q6DN14	999 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NFE2L1-223	ENST00000585299		H3BQV1	296 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	LINC00271	P0C7V0	271 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	18.76	■□□□□ 0.59	2e-6	■□□□□ 8.3
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	EMC2	Q15006	297 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	KSR1	Q8IVT5	923 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	TCP11	Q8WWU5	503 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM143	Q96AN5	459 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299		H3BNC9	293 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	FGFR4	P22455	802 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	BMPR1A	P36894	532 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PTGDR	Q13258	359 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CUL4A	Q13619	759 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	ERMN	Q8TAM6	284 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	NLRP4	Q96MN2	994 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	EYS	Q5T1H1	3165 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299		A0A087WWV3	80 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	ASAP2	O43150	1006 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	MED24	O75448	989 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	RB1	P06400	928 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	RPA1	P27694	616 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTNNB1	P35222	781 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	RARRES1	P49788	294 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	GATM	P50440	423 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NFE2L1-223	ENST00000585299	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	18.74	■□□□□ 0.59	4e-11	■■□□□ 12.9
NFE2L1-223	ENST00000585299	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		18.74	■□□□□ 0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms