RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VTNP04004 478 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRR29P0C7W0 189 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RSPH10BP0C881 870 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM62Q0P6H9 643 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAAP100Q0VG06 881 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CUL4BQ13620 913 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GIT2Q14161 759 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IER5Q5VY09 327 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TCP11Q8WWU5 503 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIGD1Q96MW7 591 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TOX2Q96NM4 488 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP7D2Q96T17 732 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPP1R16BQ96T49 567 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM9Q9C026 710 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.4■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SFI1A8K8P3 1242 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARL2P36404 184 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 THPOP40225 353 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASIC1P78348 528 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAPK7Q13164 816 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KANK3Q6NY19 840 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RSPH3Q86UC2 560 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KSR1Q8IVT5 923 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DAW1Q8N136 415 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASAP3Q8TDY4 903 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DRC1Q96MC2 740 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C7orf25Q9BPX7 421 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIPINQ9BVW5 301 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM13AO94988 1023 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLTBP09497 229 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CTSHP09668 335 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IDEP14735 1019 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTMSP20962 102 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 POSTNQ15063 836 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NFKBIBQ15653 356 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIFAP3Q92845 792 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM39AQ9NV64 488 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.38■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCN5AQ14524 2016 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GLRA2P23416 452 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PNOCQ13519 176 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CAMK4Q16566 473 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIZQ2M2Z5 673 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BSNDQ8WZ55 320 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NLRP4Q96MN2 994 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCLT1Q96NL6 688 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GINS2Q9Y248 185 aa17.37■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CKBP12277 381 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPC3P51654 580 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BFSP2Q13515 415 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CAPSQ13938 189 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CNNM4Q6P4Q7 775 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NME8Q8N427 588 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYCT1Q8N699 235 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CAGE1Q8TC20 777 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NLRP7Q8WX94 980 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFT74Q96LB3 600 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HIPK3Q9H422 1215 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PARVGQ9HBI0 331 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PANK4Q9NVE7 773 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBX21Q9UL17 535 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.36■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRIQ4A6NIV6 560 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 M0QZ92 97 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASAP2O43150 1006 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPR32O75388 356 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYL1P05976 194 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLS3P13797 630 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF131P52739 623 aa17.35■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PEX3P56589 373 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms