RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CYP3A4	P08684	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KCNC3	Q14003	757 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PRR16	Q569H4	304 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PSAP	P07602	524 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FGFR4	P22455	802 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	AVPR2	P30518	371 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CA8	P35219	290 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KRT17	Q04695	432 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PRRX2	Q99811	253 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	MAGEB2	O15479	319 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HOXA2	O43364	376 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CPA1	P15085	419 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	FGD1	P98174	961 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF862	O60290	1169 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PSMA5	P28066	241 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	TMOD1	P28289	359 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	PPM1A	P35813	382 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	KIF2C	Q99661	725 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC1-208	ENST00000576557	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557		H0Y858	1186 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	CHMP2A	O43633	222 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	OAT	P04181	439 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	GPC3	P51654	580 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	UGCG	Q16739	394 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	CASP10	Q92851	521 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	PHKB	Q93100	1093 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	GJA10	Q969M2	543 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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