RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	GJD3	Q8N144	294 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	WASF1	Q92558	559 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	FGFR4	P22455	802 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAJB1	P25685	340 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	NDUFV1	P49821	464 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	MBOAT7	Q96N66	472 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	CD320	Q9NPF0	282 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	HCST	Q9UBK5	93 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXA2	O43364	376 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	IRS1	P35568	1242 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMC5	P62195	406 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	CAMK1	Q14012	370 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	DSC3	Q14574	896 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	NECAB1	Q8N987	351 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	OXER1	Q8TDS5	423 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC01565	O15544	149 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	DRP2	Q13474	957 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	LTBR	P36941	435 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NRIP1	P48552	1158 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM189B	P81408	668 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	COL19A1	Q14993	1142 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM20A	Q96MK3	541 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	EML1	O00423	815 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FGF18	O76093	207 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	LAG3	P18627	525 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT2	P35908	639 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FOSB	P53539	338 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC42EP1	Q00587	391 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A087WZ62	844 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CTDNEP1	O95476	244 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC43	Q8N309	656 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NLRP4	Q96MN2	994 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TLE6	Q9H808	572 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TLR9	Q9NR96	1032 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	DACT1	Q9NYF0	836 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CD207	Q9UJ71	328 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TBX10	O75333	385 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NEK4	P51957	841 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE3A	Q05086	875 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP2R5C	Q13362	524 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAM15	Q13444	863 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ANO5	Q75V66	913 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	POTED	Q86YR6	584 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	VAV3	Q9UKW4	847 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	STBD1	O95210	358 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NR5A1	Q13285	461 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM29	Q14134	588 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ME3	Q16798	604 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	GTF3C6	Q969F1	213 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP170P1	Q96L14	293 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CASD1	Q96PB1	797 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CWH43	Q9H720	699 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		28.4	■■■□□ 2.14

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