RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MAP7D2	Q96T17	732 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SFI1	A8K8P3	1242 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	PITPNM1	O00562	1244 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SLC26A4	O43511	780 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	HIP1R	O75146	1068 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	DGAT1	O75907	488 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	RSPH10B	P0C881	870 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GHR	P10912	638 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CSF2RA	P15509	400 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CYP11B2	P19099	503 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	FGFR4	P22455	802 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CMA1	P23946	247 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TMOD1	P28289	359 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFA8	P51970	172 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MGAT3	Q09327	533 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MBTPS1	Q14703	1052 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TCTN1	Q2MV58	587 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	DYM	Q7RTS9	669 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP7	Q8WX94	980 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	BSND	Q8WZ55	320 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP4	Q96MN2	994 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	OSMR	Q99650	979 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GBF1	Q92538	1859 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087WZ62	844 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MYMK	A6NI61	221 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744		M0QZ92	97 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	NBN	O60934	754 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	IQCF3	P0C7M6	154 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LIG1	P18858	919 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GLRA2	P23416	452 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CASP1	P29466	404 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SYK	P43405	635 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	AFM	P43652	599 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	DNM2	P50570	870 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GPC3	P51654	580 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	EPHB4	P54760	987 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	FPGS	Q05932	587 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	RBL2	Q08999	1139 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CAPS	Q13938	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GPNMB	Q14956	572 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	E2F4	Q16254	413 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	ARSH	Q5FYA8	562 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	IER5	Q5VY09	327 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MFSD5	Q6N075	450 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	TCP11	Q8WWU5	503 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	REEP2	Q9BRK0	252 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	STK17A	Q9UEE5	414 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	PPME1	Q9Y570	386 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PQ27	194 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PQ64	194 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PQD8	194 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	GPR32	O75388	356 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	CD52	P31358	61 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	ARL2	P36404	184 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	MAPK7	Q13164	816 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	LPIN1	Q14693	890 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	FAM26D	Q5JW98	314 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RPL4-208	ENST00000564744	SV2B	Q7L1I2	683 aa		9.42	□□□□□ -0.9

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