RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 SHDQ96IW2 340 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CLIC6Q96NY7 704 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 USP16Q9Y5T5 823 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ATRNO75882 1429 aa5.12□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ABCA3Q99758 1704 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 C9orf118A6NHY6 69 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 LAMTOR5O43504 91 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 KCNQ2O43526 872 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 TNFRSF1AP19438 455 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 VAMP1P23763 118 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 STAT5AP42229 794 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MBLAC2Q68D91 279 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 WRNIP1Q96S55 665 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 JADE2Q9NQC1 790 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 BCL9O00512 1426 aa5.11□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 RECKO95980 971 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 FSHBP01225 129 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 A1BGP04217 495 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MYL6BP14649 208 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 FPR2P25090 351 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 HOXC12P31275 282 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ECI1P42126 302 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 KCNJ6P48051 423 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 GJA8P48165 433 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 INF2Q27J81 1249 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 SV2CQ496J9 727 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 KSR2Q6VAB6 950 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 COPS6Q7L5N1 327 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 G2E3Q7L622 706 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.1□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 RGPD5Q99666 1765 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MRC1P22897 1456 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ABCC4O15439 1325 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MATN3O15232 486 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MAFKO60675 156 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CPP00450 1065 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ANXA1P04083 346 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 BCL6P41182 706 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PROSER3Q2NL68 480 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 FRS2Q8WU20 508 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 DNAAF4Q8WXU2 420 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC140Q96MF4 163 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 TNNQ9UQP3 1299 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.09□□□□□ -1.59
FOXN3-210ENST00000555658 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 PALLDQ8WX93 1383 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 ALDH1L1O75891 902 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 DGKIO75912 1065 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 GNAI3P08754 354 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 GDF5P43026 501 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 STEAP3Q658P3 488 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 USP51Q70EK9 711 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.08□□□□□ -1.6
FOXN3-210ENST00000555658 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms