RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 INVSQ9Y283 1065 aa7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 SLIT2O94813 1529 aa7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NPTXRO95502 500 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 IL18BPO95998 194 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 KNG1P01042 644 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 CHGBP05060 677 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 CELA3BP08861 270 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 COL6A1P12109 1028 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 SEC23AQ15436 765 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NUDT11Q96G61 164 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 BDH2Q9BUT1 245 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 EEA1Q15075 1411 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NCANO14594 1321 aa6.99□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 SCDO00767 359 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 CPZQ66K79 652 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 KCND1Q9NSA2 647 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 DISP2A7MBM2 1401 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NOS1P29475 1434 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.98□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 PIK3R4Q99570 1358 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 KLHL18O94889 574 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 ASMTLO95671 621 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 NFATC3Q12968 1075 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 VPS72Q15906 364 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM177Q53S58 311 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 MBD6Q96DN6 1003 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM260Q9NX78 707 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 LAMC1P11047 1609 aa6.97□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.96□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ATXN3-218ENST00000553309 UTRNP46939 3433 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SLC12A8A0AV02 714 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ESYT3A0FGR9 886 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 B4E1Z4 1266 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 H0Y858 1186 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 B4GALT3O60512 393 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 B4GALT4O60513 344 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 HERVK_113P62684 666 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GALNT8Q9NY28 637 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MYOM1P52179 1685 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF536O15090 1300 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.96□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CHD4Q14839 1912 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ADGRB2O60241 1585 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 OPA1O60313 960 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ASLP04424 464 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PTGS1P23219 599 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 Q6ZUG5 572 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 BTBD7Q9P203 1132 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.95□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 M0R2C6 588 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PLATP00750 562 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ITGB3P05106 788 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MMEP08473 750 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SDSP20132 328 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 AOAHP28039 575 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 IGFALSP35858 605 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 DLG3Q92796 817 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 INCENPQ9NQS7 918 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms