RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 C22orf31O95567 290 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 VTNP04004 478 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 WEE2P0C1S8 567 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 ARP10275 920 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 CTSAP10619 480 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 ZNF76P36508 570 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.248e-6■■□□□ 13.7
CS-228ENST00000551473 BCAR1P56945 870 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 NUCB1Q02818 461 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.54□□□□□ -0.24
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CS-228ENST00000551473 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 SIX5Q8N196 739 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 RNF169Q8NCN4 708 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.54□□□□□ -0.24
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CS-228ENST00000551473 LY9Q9HBG7 655 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 AKT3Q9Y243 479 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 A0A0U1RQF3 1178 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 MEIS1O00470 390 aa13.53□□□□□ -0.24
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CS-228ENST00000551473 EPCAMP16422 314 aa13.53□□□□□ -0.24
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CS-228ENST00000551473 ANTXR2P58335 489 aa13.53□□□□□ -0.24
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CS-228ENST00000551473 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 TMEM87BQ96K49 555 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 FAM167AQ96KS9 214 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 KCNK12Q9HB15 430 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 WNT16Q9UBV4 365 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 MYO10Q9HD67 2058 aa13.52□□□□□ -0.24
CS-228ENST00000551473 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 CCNE2O96020 404 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SKIP12755 728 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 AP3B2Q13367 1082 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 HELQQ8TDG4 1101 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.52□□□□□ -0.25
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CS-228ENST00000551473 ANO3Q9BYT9 981 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 IL25Q9H293 177 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 RIC8AQ9NPQ8 531 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 DPP7Q9UHL4 492 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 PSAPP07602 524 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SDHBP21912 280 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 MCM5P33992 734 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SREBF1P36956 1147 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 LIFRP42702 1097 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 NAPAP54920 295 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 LETM2Q2VYF4 491 aa13.51□□□□□ -0.25
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CS-228ENST00000551473 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.51□□□□□ -0.25
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CS-228ENST00000551473 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 IGSF21Q96ID5 467 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 CHST12Q9NRB3 414 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 CACNA1AO00555 2505 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 PRC1O43663 620 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 KLRC2P26717 231 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 CLCN3P51790 818 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 ADCY7P51828 1080 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 CDC42EP1Q00587 391 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 PTH1RQ03431 593 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-228ENST00000551473 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.5□□□□□ -0.25
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