RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 ARL5CA6NH57 179 aa3.35□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 S100A2P29034 98 aa3.34□□□□□ -1.87
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JMJD1C-210ENST00000542921 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 ZWILCHQ9H900 591 aa3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 OGFRQ9NZT2 677 aa3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
JMJD1C-210ENST00000542921 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.34□□□□□ -1.87
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