RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CASP14P31944 242 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 AP3B2Q13367 1082 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PRKG1Q13976 671 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PDIA5Q14554 519 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NPY5RQ15761 445 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CYTH2Q99418 400 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 POTEB3A0JP26 581 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC188H7C350 402 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 IRF6O14896 467 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ACADSP16219 412 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GUCY2DQ02846 1103 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GABPAQ06546 454 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 POTEBQ6S5H4 581 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DISC1Q9NRI5 854 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GINM1Q9NU53 330 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TRPC6Q9Y210 931 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 UBE4BO95155 1302 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 AHCYL1O43865 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DDHD2O94830 711 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINB6P35237 376 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SMTNP53814 917 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CUL4BQ13620 913 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF174Q15697 407 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CASP10Q92851 521 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GTH6 734 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 M0R2N6 131 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FAM200BP0CF97 657 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINB3P29508 390 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GUCY1A3Q02108 690 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PAK1Q13153 545 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 THAP9Q9H5L6 903 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SH2D4AQ9H788 454 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 POLLQ9UGP5 575 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TAF1P21675 1872 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GTF2IP78347 998 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCZ1BP86790 482 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SLC7A5Q01650 507 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP4Q13107 963 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MKL1Q969V6 931 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KRT9P35527 623 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CUL5Q93034 780 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ATP2A3Q93084 1043 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP40Q9NVE5 1235 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 STK32BQ9NY57 414 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SMCO2A6NFE2 343 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GNA14O95837 355 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RCN2Q14257 317 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC14Q49A88 953 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DENND2CQ68D51 928 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.51□□□□□ -1.37
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