RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DYMQ7RTS9 669 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 AZIN2Q96A70 460 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 STOML1Q9UBI4 398 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PARP6Q2NL67 630 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 AADACL2Q6P093 401 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 USP20Q9Y2K6 914 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SETDB1Q15047 1291 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.03■□□□□ 0.88e-7■□□□□ 10.2
PACS1-205ENST00000527224 SEC14L1Q92503 715 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 GATA6Q92908 595 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ERP44Q9BS26 406 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MYH4Q9Y623 1939 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 ALDH1B1P30837 517 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PTK2Q05397 1052 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TMCO1Q9UM00 188 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 GFPT2O94808 682 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PLCG2P16885 1265 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 IQCDQ96DY2 449 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 T-ENOLP0DO92 83 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 DUPD1Q68J44 220 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 C18orf8Q96DM3 657 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-205ENST00000527224 TBX10O75333 385 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 FUT2Q10981 343 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ESR2Q92731 530 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 MAGEB3O15480 346 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 LYNP07948 512 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 JAMLQ86YT9 394 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 IP6K1Q92551 441 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 RIPK2O43353 540 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ACTN1P12814 892 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 BRAFP15056 766 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC3Q13217 504 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 TMED1Q13445 227 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 RNF43Q68DV7 783 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 PFASO15067 1338 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 FOXN2P32314 431 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 LLGL1Q15334 1064 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ASIC2Q16515 512 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 CEP72Q9P209 647 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 GSG1L2A8MUP6 293 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 CBX3Q13185 183 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 GIT2Q14161 759 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 HSFX1Q9UBD0 423 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 LSAMPQ13449 338 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 SLX1AQ9BQ83 275 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 FAM192AQ9GZU8 254 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-205ENST00000527224 OSGEPQ9NPF4 335 aa20■□□□□ 0.79
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