RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527018.5

CTSC-204, Transcript of cathepsin C, human

TSL 5

Gene CTSC, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-204	ENST00000527018	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PHKB	Q93100	1093 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ZNF558	Q96NG5	402 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TCF25	Q9BQ70	676 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	FSCN2	O14926	492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	OAT	P04181	439 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	FGFR4	P22455	802 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PPM1A	P35813	382 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	FAM189B	P81408	668 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PRKCE	Q02156	737 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	KRT17	Q04695	432 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PKN1	Q16512	942 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	GAS7	O60861	476 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ABCB7	O75027	752 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	MSH4	O15457	936 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ZNF862	O60290	1169 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CIITA	P33076	1130 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	GPC3	P51654	580 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	JAK3	P52333	1124 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NLRP5	P59047	1200 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	UGCG	Q16739	394 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PRSS33	Q8NF86	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SUSD6	Q92537	303 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	GJA10	Q969M2	543 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SFN	P31947	248 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PTPN5	P54829	565 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	IER5L	Q5T953	404 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	CASP10	Q92851	521 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	LENG9	Q96B70	501 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	RIT2	Q99578	217 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	S1PR5	Q9H228	398 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	NID2	Q14112	1375 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	DNM2	P50570	870 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTSC-204	ENST00000527018	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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