RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524233.1

RNF19A-215, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene RNF19A, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-215	ENST00000524233	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	CUX2	O14529	1486 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233		A0A1W2PRX2	142 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	CAPN14	A8MX76	684 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ZNF202	O95125	648 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	C1S	P09871	688 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ZNF174	Q15697	407 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	DGKD	Q16760	1214 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	TTC38	Q5R3I4	469 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SUV39H1	O43463	412 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	CYP17A1	P05093	508 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	JMJD7	P0C870	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SDS	P20132	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	FLT3	P36888	993 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ANTXR2	P58335	489 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	ACAP1	Q15027	740 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	C16orf92	Q96LL3	132 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF19A-215	ENST00000524233	CBX4	O00257	560 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ASMTL	O95671	621 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ADCY7	P51828	1080 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ABHD18	Q0P651	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	C2orf78	A6NCI8	922 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	SLC9A1	P19634	815 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	BPIFB4	P59827	614 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	EPHA7	Q15375	998 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	NME9	Q86XW9	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	DYDC2	Q96IM9	177 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	TMEM260	Q9NX78	707 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CYP27B1	O15528	508 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	FHL2	Q14192	279 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CFAP100	Q494V2	611 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	GPHA2	Q96T91	129 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	RFPL3	O75679	317 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	BCAR1	P56945	870 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ADAM8	P78325	824 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CRHR2	Q13324	411 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	WDR92	Q96MX6	357 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	DNAI1	Q9UI46	699 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	MCM7	P33993	719 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	GAREM2	Q75VX8	874 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	CLEC14A	Q86T13	490 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	APOL3	O95236	402 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ADCY2	Q08462	1091 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ADCY1	Q08828	1119 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	TUBA3C	Q13748	450 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	UBXN4	Q92575	508 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RNF19A-215	ENST00000524233	TOMM22	Q9NS69	142 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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