RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 UGCGQ16739 394 aa23.5■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 LRRC43Q8N309 656 aa23.5■■□□□ 1.35
PABPC1-218ENST00000521865 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.5■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 MTERF2Q49AM1 385 aa23.49■■□□□ 1.35
PABPC1-218ENST00000521865 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PABPC1-218ENST00000521865 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.49■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.49■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 EDIL3O43854 480 aa23.48■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 PPM1AP35813 382 aa23.47■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 PLCB3Q01970 1234 aa23.46■■□□□ 1.35
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PABPC1-218ENST00000521865 TECP42680 631 aa23.45■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 HELQQ8TDG4 1101 aa23.45■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 A0A0U1RQF3 1178 aa23.44■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.44■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.44■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 APOL5Q9BWW9 433 aa23.44■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 EVPLQ92817 2033 aa23.43■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 EOMESO95936 686 aa23.43■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 GALNT17Q6IS24 598 aa23.42■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.42■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.42■■□□□ 1.34
PABPC1-218ENST00000521865 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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PABPC1-218ENST00000521865 FBXL18Q96ME1 805 aa23.42■■□□□ 1.34
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