RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 KLHL30Q0D2K2 578 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 XKR9Q5GH70 373 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 C12orf56Q8IXR9 622 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SAR1BQ9Y6B6 198 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 TACC1O75410 805 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SLC18A3Q16572 532 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CHST13Q8NET6 341 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SPAG5Q96R06 1193 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 EPC1Q9H2F5 836 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE8P0CG41 777 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 FMO5P49326 533 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 NCKAP1LP55160 1127 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 GTF2BQ00403 316 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 NPEPPSP55786 919 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 JAM2P57087 298 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ANO5Q75V66 913 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 WDR81Q562E7 1941 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ADM5C9JUS6 153 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 EXOC3O60645 756 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 GNPTABQ3T906 1256 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 TREML2Q5T2D2 321 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 DLK2Q6UY11 383 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SULF1Q8IWU6 871 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 CSADQ9Y600 493 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PRKCIP41743 596 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ARID5AQ03989 594 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 BFSP1Q12934 665 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 LBX2Q6XYB7 198 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 IWS1Q96ST2 819 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 RNF181Q9P0P0 153 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 STBD1O95210 358 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 MOCS3O95396 460 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ARID2Q68CP9 1835 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 A0A087X0T9 212 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF862O60290 1169 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PSAPP07602 524 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 FAM228BP0C875 321 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 PEX3P56589 373 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 DNERQ8NFT8 737 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 OGFRQ9NZT2 677 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-223ENST00000515011 POTEB2H3BUK9 544 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 ANXA13P27216 316 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 IQCEQ6IPM2 695 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM49P0CI25 452 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM49CP0CI26 452 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 PTK2Q05397 1052 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 CBWD6Q4V339 395 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 HVCN1Q96D96 273 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 SLC16A4O15374 487 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 PFASO15067 1338 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 TISP43B9A030 160 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 MAPK13O15264 365 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 KRT13P13646 458 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 ACTR2P61160 394 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 MYL7Q01449 175 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-223ENST00000515011 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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