RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ARAP1Q96P48 1450 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MAFGO15525 162 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 INSRRP14616 1297 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 LSP1P33241 339 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 STAT3P40763 770 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MEOX1P50221 254 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ANTXR2P58335 489 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ADAM17P78536 824 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ADCY2Q08462 1091 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ICAM4Q14773 271 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MYBPC3Q14896 1274 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 RNF151Q2KHN1 245 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 OR10A2Q9H208 303 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGAP6O43182 974 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ZEB2O60315 1214 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MRE11P49959 708 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 RRADP55042 308 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 IL2P60568 153 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 RAC3P60763 192 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 TERF2Q15554 542 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 TBR1Q16650 682 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 DGKDQ16760 1214 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 AGBL4Q5VU57 503 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 C11orf74Q86VG3 221 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 C7orf31Q8N865 590 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 CHST13Q8NET6 341 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 LMF1Q96S06 567 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 GPR20Q99678 358 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MSL2Q9HCI7 577 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0A6YYJ9 748 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 STAT5BP51692 787 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 DNERQ8NFT8 737 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 LPPQ93052 612 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 GNRHR2Q96P88 292 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 MYL10Q9BUA6 226 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 EMC7Q9NPA0 242 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 NR2E1Q9Y466 385 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-220ENST00000512069 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF20P17024 532 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 SOX5P35711 763 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 USP7Q93009 1102 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 TTC1Q99614 292 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 POFUT1Q9H488 388 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 IFT22Q9H7X7 185 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 MSRAQ9UJ68 235 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 PATE3B3GLJ2 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 MATN2O00339 956 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 CR2P20023 1033 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 HGFACQ04756 655 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 BROXQ5VW32 411 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-220ENST00000512069 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.45□□□□□ -1.38
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