RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ABCC1P33527 1531 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MATN2O00339 956 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SDHAP31040 664 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 GDF5P43026 501 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SELENOPP49908 381 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NFYCQ13952 458 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 BRAPQ7Z569 592 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SYNMO15061 1565 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MED14O60244 1454 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 KIF14Q15058 1648 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NPTXRO95502 500 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 AMHP03971 560 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MMEP08473 750 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TBR1Q16650 682 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N1X5 172 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ASB15Q8WXK1 588 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SCYL1Q96KG9 808 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO10Q9UK96 956 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SCDO00767 359 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TACR2P21452 398 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ECE1P42892 770 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CFHR4Q92496 578 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 A2MP01023 1474 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.38e-7■■■■□ 24
PDE4D-217ENST00000509355 RAC3P60763 192 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CD83Q01151 205 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZSN1 163 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 OR10A5Q9H207 317 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 VPS11Q9H270 941 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ASB1Q9Y576 335 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SLC12A8A0AV02 714 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PLD2O14939 933 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 HMGA2P52926 109 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM177Q53S58 311 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 HS1BP3Q53T59 392 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 USP51Q70EK9 711 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 FUKQ8N0W3 1084 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 EDAQ92838 391 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 GBP4Q96PP9 640 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF747Q9BV97 191 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MIA2Q96PC5 1412 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 NLRP1Q9C000 1473 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 IQGAP1P46940 1657 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 DEPDC5O75140 1603 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM94Q12767 1356 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MUSKO15146 869 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 FOXP2O15409 715 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 RAD17O75943 681 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 CR2P20023 1033 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY8P40145 1251 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.88□□□□□ -1.31
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