RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CYP3A4P08684 503 aa26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF558Q96NG5 402 aa26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 NR2E1Q9Y466 385 aa26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 KRT17Q04695 432 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 RTN1Q16799 776 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 METTL13Q8N6R0 699 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 CASP10Q92851 521 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 APOL5Q9BWW9 433 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D22BQ9NU19 505 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.16■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB33Q86T24 672 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 SPG21Q9NZD8 308 aa26.15■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEB2O15479 319 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 TMC7Q7Z402 723 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ABI1Q8IZP0 508 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.14■■□□□ 1.78
SIMC1-208ENST00000495423 DMDP11532 3685 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB43O43298 467 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 PBX3P40426 434 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ITIH3Q06033 890 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.13■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 PROB1E7EW31 1015 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 PSAPP07602 524 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 RPS6KB1P23443 525 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CLCN3P51790 818 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MTMR3Q13615 1198 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CES5AQ6NT32 575 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 RUFY3Q7L099 469 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MAP7D2Q96T17 732 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 POMKQ9H5K3 350 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CDH22Q9UJ99 828 aa26.12■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 RCAN1P53805 252 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MCTP2Q6DN12 878 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 FAM167AQ96KS9 214 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GABBR1Q9UBS5 961 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 AKT3Q9Y243 479 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.11■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ESYT2A0FGR8 921 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 H0Y858 1186 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 EOMESO95936 686 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 TMOD1P28289 359 aa26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 A0A0U1RQF3 1178 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 BRD1O95696 1058 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 CDC27P30260 824 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MTHFRP42898 656 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms