RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.3■□□□□ 0.52
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TOM1-216ENST00000492723 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
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TOM1-216ENST00000492723 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.26■□□□□ 0.51
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TOM1-216ENST00000492723 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 MAF1Q9H063 256 aa18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 ZMYND15Q9H091 742 aa18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.26■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.25■□□□□ 0.51
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