RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF605Q86T29 641 aa9.92□□□□□ -0.82
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PTPRC-212ENST00000491302 WRNIP1Q96S55 665 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 MTG2Q9H4K7 406 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-212ENST00000491302 NRP2O60462 931 aa9.91□□□□□ -0.82
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PTPRC-212ENST00000491302 CYP7B1O75881 506 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRC-212ENST00000491302 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 FAM168AQ92567 244 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 COA7Q96BR5 231 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRC-212ENST00000491302 MALLQ13021 153 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 RUNDC1Q96C34 613 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K14Q99558 947 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO10Q9UK96 956 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 PEX14O75381 377 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 PAPLNO95428 1278 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 MC3RP41968 323 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA1P56199 1179 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-212ENST00000491302 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.85□□□□□ -0.83
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