RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 NEK9Q8TD19 979 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 POLD4Q9HCU8 107 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 MSRAQ9UJ68 235 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PRPHP41219 470 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 GATMP50440 423 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 DSC3Q14574 896 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 HSCBQ8IWL3 235 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 USP38Q8NB14 1042 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC15Q8TF66 581 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP7D2Q96T17 732 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKEF1Q9NU02 776 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 MYO9BQ13459 2157 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 STX6O43752 255 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 EFCAB14O75071 495 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 AMHP03971 560 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 TMOD1P28289 359 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRE1Q14246 886 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PDIA5Q14554 519 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPAQ15257 358 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 BRAPQ7Z569 592 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 PNMA5Q96PV4 448 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 LINC01553A4QN01 128 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 E9PMD0 336 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 LINC00271P0C7V0 271 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 RFC5P40937 340 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRP7Q8WX94 980 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRP4Q96MN2 994 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 RAD9AQ99638 391 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAM2Q99965 735 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-202ENST00000490575 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 LAD1O00515 517 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 PDCP20941 246 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 ARL2P36404 184 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 PLIN2Q99541 437 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 MTRQ99707 1265 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 C9IYK1 514 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 GLRA2P23416 452 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 GRB10Q13322 594 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 BSNDQ8WZ55 320 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 NACC1Q96RE7 527 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 USP28Q96RU2 1077 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 RGS18Q9NS28 235 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 HCSTQ9UBK5 93 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 PPME1Q9Y570 386 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR182O15218 404 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 DGKIO75912 1065 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 DNM2P50570 870 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 CAPSQ13938 189 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 USP49Q70CQ1 688 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 SCLT1Q96NL6 688 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRVP-202ENST00000490575 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms