RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.74e-11■■■■□ 19.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3D21A4FU49 640 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ESF4 209 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRDO14764 452 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MT-CO1P00395 513 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 LPLP06858 475 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CARFQ8N187 725 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MTG2Q9H4K7 406 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 WASHC2AQ641Q2 1341 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL18O94889 574 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDH8O95206 1070 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CHGBP05060 677 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MYBL2P10244 700 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ENPP1P22413 925 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR3P46089 330 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNQ1P51787 676 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 BCAR1P56945 870 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 NFATC3Q12968 1075 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MCTP2Q6DN12 878 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ACAP3Q96P50 834 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MENTQ9BUN1 341 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNG1Q9UIX4 513 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 EDARQ9UNE0 448 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MYPNQ86TC9 1320 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT140Q96RY7 1462 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR97A6NE52 1622 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0G2JNJ9 132 aa4.42□□□□□ -1.7
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RABGGTB-211ENST00000489450 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
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RABGGTB-211ENST00000489450 CELA3BP08861 270 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CFPP27918 469 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 STAT5BP51692 787 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ANTXR2P58335 489 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 UGT8Q16880 541 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 INAVAQ3KP66 663 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QL4Q86Z23 238 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP89Q96ST8 783 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.42□□□□□ -1.7
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RABGGTB-211ENST00000489450 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 Q9UFV3 132 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 USP18Q9UMW8 372 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TNKSO95271 1327 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0A6YYJ9 748 aa4.41□□□□□ -1.7
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RABGGTB-211ENST00000489450 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 POLD1P28340 1107 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SLURP1P55000 103 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 PPARAQ07869 468 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K12Q12852 859 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 DGKDQ16760 1214 aa4.41□□□□□ -1.7
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