RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PDIA5Q14554 519 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ARNTL2Q8WYA1 636 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RGS18Q9NS28 235 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ASAP2O43150 1006 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF15O94989 841 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PRPHP41219 470 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RPA1P27694 616 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PTGDRQ13258 359 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DRP2Q13474 957 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RHPN2Q8IUC4 686 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ADAM2Q99965 735 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CDH23Q9H251 3354 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DGAT1O75907 488 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DGKIO75912 1065 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 IGFBP4P22692 258 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 EMC2Q15006 297 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 FIBCD1Q8N539 461 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 NACC1Q96RE7 527 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 MTRQ99707 1265 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CERS4Q9HA82 394 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 COL6A3P12111 3177 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ADGRE1Q14246 886 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DSC3Q14574 896 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CHST12Q9NRB3 414 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 A0A087WZ62 844 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 C9IYK1 514 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 MGEA5O60502 916 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RARRES1P49788 294 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 NBR1Q14596 966 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 BRAPQ7Z569 592 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 SNX21Q969T3 373 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 DACT1Q9NYF0 836 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-211ENST00000489379 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB39O15060 712 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 FAM189BP81408 668 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 MED24O75448 989 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 FERMT3Q86UX7 667 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TMEM143Q96AN5 459 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 NLRP4Q96MN2 994 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 TRANK1O15050 2925 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 EPOPA6NHQ4 379 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 BMP15O95972 392 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 RB1P06400 928 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 POU5F1BQ06416 359 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 PIGOQ8TEQ8 1089 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD1-211ENST00000489379 HOXA2O43364 376 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms