RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CD83Q01151 205 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SSPNQ14714 243 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CLUL1Q15846 466 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FBXO10Q9UK96 956 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 A0A0A6YYJ9 748 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KLHL33A6NCF5 533 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 H0Y858 1186 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 AKAP10O43572 662 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NUAK1O60285 661 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 OPHN1O60890 802 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDH8O95206 1070 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KNG1P01042 644 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 LPLP06858 475 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PI3P19957 117 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CAP1Q01518 475 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PPP2R5AQ15172 486 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PRR31Q5SQ13 230 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KCNK18Q7Z418 384 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PWWP2AQ96N64 755 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 EDARQ9UNE0 448 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA12O60330 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CUTAO60888 179 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 COL6A1P12109 1028 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MTNR1BP49286 362 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 GPR15P49685 360 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 DGKDQ16760 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TOR2AQ5JU69 321 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CDH19Q9H159 772 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PRSS50Q9UI38 385 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 ABLIM3O94929 683 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 ZNF28P17035 718 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 AGXTP21549 392 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 IL13P35225 146 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A3P53794 718 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 LGALS4P56470 323 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 PPARAQ07869 468 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 SPIDRQ14159 915 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 ACAP2Q15057 778 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 MUM1Q2TAK8 710 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 TMEM240Q5SV17 173 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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