RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 HOXA2O43364 376 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDKL5O76039 1030 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 FGFR1P11362 822 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 NDUFV1P49821 464 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 XKR3Q5GH77 459 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 EFHBQ8N7U6 833 aa20.19■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.19■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 LAG3P18627 525 aa20.18■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDC42EP1Q00587 391 aa20.18■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 SCLT1Q96NL6 688 aa20.18■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.18■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 NRIP1P48552 1158 aa20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 SCRN1Q12765 414 aa20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 INF2Q27J81 1249 aa20.17■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 HCSTQ9UBK5 93 aa20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 STK36Q9NRP7 1315 aa20.17■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.16■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 STBD1O95210 358 aa20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 EYA4O95677 639 aa20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 XBP1P17861 261 aa20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.16■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 CEP89Q96ST8 783 aa20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 TLE6Q9H808 572 aa20.16■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.15■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 ABI1Q8IZP0 508 aa20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRRC43Q8N309 656 aa20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM122AQ96E09 287 aa20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ATP6AP1-208ENST00000484908 DACT1Q9NYF0 836 aa20.15■□□□□ 0.82
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ATP6AP1-208ENST00000484908 PRR33A8MZF0 331 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 FSCN2O14926 492 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC37A4O43826 429 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PFKFB2O60825 505 aa20.14■□□□□ 0.81
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ATP6AP1-208ENST00000484908 EOMESO95936 686 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERVFC1P60507 584 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PSMC5P62195 406 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 NEK8Q86SG6 692 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM20AQ96MK3 541 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 CHST12Q9NRB3 414 aa20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMEM150BA6NC51 233 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 FGFR4P22455 802 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPM1AP35813 382 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANAPC15P60006 121 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP2R5CQ13362 524 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF410Q86VK4 478 aa20.13■□□□□ 0.81
ATP6AP1-208ENST00000484908 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.13■□□□□ 0.81
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