RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	CXorf38	Q8TB03	319 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	USP6NL	Q92738	828 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281		R4GN57	208 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281		F8W031	263 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PLCB3	Q01970	1234 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	CLUL1	Q15846	466 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	PTPRF	P10586	1907 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281		A0A1B0GUL6	1792 aa		5.21	□□□□□ -1.57
RAB18-205	ENST00000484281	KBTBD13	C9JR72	458 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PRB1	P04280	392 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	KLRK1	P26718	216 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	CNGA1	P29973	690 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	LTBR	P36941	435 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ETV3	P41162	512 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	SHC2	P98077	582 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC6	Q16204	474 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RUBCN	Q92622	972 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ARID3A	Q99856	593 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	SP110	Q9HB58	689 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	LCHN	A4D1U4	455 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	TRIM13	O60858	407 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	FBXO24	O75426	580 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	CYP2C18	P33260	490 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	EGR3	Q06889	387 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	NR0B2	Q15466	257 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	TREML2	Q5T2D2	321 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	GGN	Q86UU5	652 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	IL23A	Q9NPF7	189 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	SPTA1	P02549	2419 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ATM	Q13315	3056 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PTPRS	Q13332	1948 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	MBTPS2	O43462	519 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	MYO1B	O43795	1136 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	C1QL1	O75973	258 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	FGB	P02675	491 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	CELA3B	P08861	270 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	CACNB3	P54284	484 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ANGPT1	Q15389	498 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	PARP10	Q53GL7	1025 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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