RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 NAGPAQ9UK23 515 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 BCS1LQ9Y276 419 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.65□□□□□ -0.06
SYCE1-205ENST00000479535 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TISP43B9A030 160 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 VWA5AO00534 786 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DNA2P51530 1060 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC181Q5TID7 509 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PXMP2Q9NR77 195 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 EXOC3O60645 756 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 ITIH3Q06033 890 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TSKSQ9UJT2 592 aa14.64□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 GFPT2O94808 682 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 BACE1P56817 501 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 BACH1O14867 736 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 LYPLA2O95372 231 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 PAFAH1B1P43034 410 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 BFSP1Q12934 665 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PPP2R5AQ15172 486 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.63□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 F8VZ95 297 aa14.62□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 STAT1P42224 750 aa14.62□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 WRNIP1Q96S55 665 aa14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 RNF146Q9NTX7 359 aa14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 NENFQ9UMX5 172 aa14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MYH11P35749 1972 aa14.62□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 FZD9O00144 591 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 EVI5O60447 810 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PTPRAP18433 802 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 GYS2P54840 703 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DLG4P78352 724 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 MAP9Q49MG5 647 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 C4orf19Q8IY42 314 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.61□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM206Q9H813 350 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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SYCE1-205ENST00000479535 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 STK33Q9BYT3 514 aa14.61□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 WDR64B1ANS9 1081 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 HMGCS2P54868 508 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 NPEPPSP55786 919 aa14.6□□□□□ -0.07
SYCE1-205ENST00000479535 PSMC5P62195 406 aa14.6□□□□□ -0.07
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