RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 THPOP40225 353 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 FAM26DQ5JW98 314 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 NME8Q8N427 588 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TCP11Q8WWU5 503 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 STAMQ92783 540 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PAGE5Q96GU1 130 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MAP7D2Q96T17 732 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 HIPK3Q9H422 1215 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 SIP14410 1827 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GPR32O75388 356 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CHRNA1P02708 482 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RSPH10BP0C881 870 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GLRA2P23416 452 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DNM2P50570 870 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ZNF131P52739 623 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 BFSP2Q13515 415 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GIT2Q14161 759 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 BSNDQ8WZ55 320 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DDX12PQ92771 950 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TRIM9Q9C026 710 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 POLD4Q9HCU8 107 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 EVI5O60447 810 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GPC3P51654 580 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MBTPS1Q14703 1052 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RSPH3Q86UC2 560 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 KSR1Q8IVT5 923 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 KIFAP3Q92845 792 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TIGD1Q96MW7 591 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 AKT3Q9Y243 479 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CTSHP09668 335 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 SELPP16109 830 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CAPSQ13938 189 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CNNM3Q8NE01 707 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DRC1Q96MC2 740 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DACT1Q9NYF0 836 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 LTBP2Q14767 1821 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CAPN15O75808 1086 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TIMP1P01033 207 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CASP1P29466 404 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CYP2C18P33260 490 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 AFMP43652 599 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GPNMBQ14956 572 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 KIZQ2M2Z5 673 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DYMQ7RTS9 669 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 GPT2Q8TD30 523 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ASAP2O43150 1006 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 IQCF3P0C7M6 154 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PRR29P0C7W0 189 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 AMPD3Q01432 767 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 CUL4BQ13620 913 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ZNF410Q86VK4 478 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 DPF3Q92784 378 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 VWCEQ96DN2 955 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms