RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 BORCS6Q96GS4 357 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM169Q96HH4 297 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MYADMQ96S97 322 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 BCO2Q9BYV7 579 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 LAMA5O15230 3695 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZBTB5O15062 677 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ATP9AO75110 1047 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 KCNA2P16389 499 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 AAMPQ13685 434 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 FAM228AQ86W67 206 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ESR2Q92731 530 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SOBPA7XYQ1 873 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 TBC1D4O60343 1298 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 CTSAP10619 480 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 BCAR1P56945 870 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 FAM189BP81408 668 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SHC2P98077 582 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 DSC3Q14574 896 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 TSSK4Q6SA08 328 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MTMR8Q96EF0 704 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PCYT2Q99447 389 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 IRAK3Q9Y616 596 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZMYM6O95789 1325 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GPR182O15218 404 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 STARD6P59095 220 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ODR4Q5SWX8 454 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 NLRX1Q86UT6 975 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 NME8Q8N427 588 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 HELQQ8TDG4 1101 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 STAMQ92783 540 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 OSMRQ99650 979 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GDF9O60383 454 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 CLCN4P51793 760 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 HTR4Q13639 388 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GIT2Q14161 759 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 WTAPQ15007 396 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 KIZQ2M2Z5 673 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 IQCA1Q86XH1 822 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 NELL1Q92832 810 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 NXPE3Q969Y0 559 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SHDQ96IW2 340 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 RAB23Q9ULC3 237 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 WDR81Q562E7 1941 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 F5P12259 2224 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 KLRF2D3W0D1 207 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 C1QTNF9P0C862 333 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 GPRASP2Q96D09 838 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 PIGSQ96S52 555 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 AZI2Q9H6S1 392 aa14.46□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms